חטיבת הביניים "אלון" הוקמה בשנת 1980 ונקראת על שמו של יגאל אלון, ז"ל.

על קיר הכניסה לחטיבה מופיע מוטו ביה"ס הלקוח מדבריו של יגאל אלון:

כדי לבנות חברת מופת צודקת עלינו להבטיח ארבע חרויות:"

חירות מעוני, חירות מעושק, חירות מנחשלות וחירות מבערות"

ברוח הדברים הללו, ומתוך תפיסה הרואה בתלמיד של היום את בוגר המחר – אזרח מדינת ישראל ואיש העולם הגדול – הציב בית הספר את הערכים לאורם יילך, וניסח את חזונו:

"להיות ארגון מוביל להעצמת האדם במישור האינטלקטואלי, הרגשי והחברתי. ארגון המציב לכל תלמידיו, מוריו ועובדיו הזדמנות לעשייה משותפת, להתפתחות אישית, למיצוי היכולת הלימודית והכישורים המנהיגותיים והחברתיים.

ארגון הפועל ליצירת תחומי עניין המושתתים על ערכי אהבת הארץ, כבוד לזולת ומחוייבות לקהילה".

ארגון העושה לפיתוח אדם אורייני, בעל מסוגלות לתפקוד והשתלבות בחברה משתנה על רבדיה השונים" .

התפיסה החינוכית בחטיבה מושתתת על הערכים אותם הציבה החטיבה להיות אלה המובילים את עשייתה: כבוד האדם, אהבת הדעת, אחריות, חיבור למורשת ולתרבות. וככזו, היא מכירה בשונות בין התלמידים ודוגלת בגישה המאפשרת התייחסות אישית ומתן הזדמנות שווה ואמיתית לכל תלמיד.ה

בהתאם לכך חקקה החטיבה על דגלה את המוטו: "הדרך של כל תלמיד.ה לצמרת", והיא מציעה לתלמידים מגוון אפשרויות להתפתחות בתחומים שונים, העשרה ולימוד, ושוקדת על מתן מענה לכל תלמיד.ה ומציאת הדרך לקידומו.ה

החטיבה מציעה מערך תמיכה מקיף הכולל שעות פרטניות, שעות הקניית מיומנויות חקר, אסטרטגיות למידה, מיומנויות הדרושות להתנהלות כלומד עצמאי,  מערך מתנדבים המגיעים לסייע בלמידה, ומענים חברתיים ורגשיים.

בחטיבה קיימים מסלולים המאפשרים לתלמידים להתקדם בתחומי העניין שלהם, ולהביא לידי ביטוי את כישוריהם ויכולותיהם. המסלולים הקיימים בחטיבה הם: מחול, מוסיקה, אומנות, כדורסל בנים, כדורשת בנות, קולנוע, רובוטיקה.

כחטיבה המקדמת מצויינות, מטפח ביה"ס את אוכלוסיית התלמידים המצטיינים:                               

בביה"ס קיימת כיתת עתודה מדעית-טכנולוגית של משרד החינוך, המציעה תכנית לימודים ייחודית בתחומי המדעים, המתמטיקה ומדעי המחשב. מרבית תלמידי העתודה ממשיכים לימודיהם בתיכון מור מטרו-ווסט במגמות ההייטק והמחשבים.

בנוסף לכיתת העתודה המדעית-טכנולוגית, קיימת בבית הספר כיתת מנהיגות ששמה לה למטרה לפתח ולטפח כישורי המנהיגות של תלמידיה. כיתות ייחודיות אלה קיימות בכל שכבות הגיל בביה"ס.

גם בתחום ענפי הספורט השונים שוקד ביה"ס לקדם את תלמידיו, לוקח חלק בפעילויות ובתחרויות ספורט רבות, ומגיע להישגים מכובדים. אורח חיים בריא מובל בחטיבה כתכנית ייחודית  הכוללת שיעורים המקנים הרגלי אורח חיים בריא, ופעילויות יזומות עם הקהילה והחברה תחת הכותרת: "קיימות – שומרים על כדור הארץ".

כחטיבה הרואה את העשייה החברתית ואת ההתנדבות בקהילה כאבן יסוד בתרבותה הארגונית, מתקיימות פעילויות חברתיות רבות ומגוונות המאפשרות לכלל התלמידים לקחת חלק פעילו ומשמעותי הן בביה"ס והן בקהילה. ביה"ס, בשיתוף עם אלוף יורם יאיר, דואג לשמר את מפעל ההנצחה "על"ה שלומית" כמפעל הוקרה לתלמידים הפעילים ומתנדבים בחברה ובקהילה, ומנציח בדרך ייחודית זו את סרן שלומית יאיר, ז"ל, תלמידת החטיבה שנפלה בעת שירותה הצבאי.

כחטיבה הדוגלת בקיום דיאלוג בין כל באי בית הספר, פועל ביה"ס בשיתוף פעולה הנהגת ההורים, גוף שנבחר לייצג את הורי התלמידים כולם.